improved PHP parser
[phpeclipse.git] / net.sourceforge.phpeclipse / src / net / sourceforge / phpeclipse / builder / IdentifierIndexManager.java
index dd2672b..8e859cf 100644 (file)
@@ -1,5 +1,6 @@
 package net.sourceforge.phpeclipse.builder;
 
+import java.io.BufferedInputStream;
 import java.io.BufferedReader;
 import java.io.FileNotFoundException;
 import java.io.FileReader;
@@ -8,97 +9,253 @@ import java.io.IOException;
 import java.io.InputStream;
 import java.util.ArrayList;
 import java.util.Collection;
+import java.util.Comparator;
 import java.util.HashMap;
+import java.util.HashSet;
 import java.util.Iterator;
 import java.util.List;
+import java.util.Set;
+import java.util.SortedMap;
 import java.util.StringTokenizer;
+import java.util.TreeMap;
 
 import net.sourceforge.phpdt.core.compiler.ITerminalSymbols;
 import net.sourceforge.phpdt.core.compiler.InvalidInputException;
 import net.sourceforge.phpdt.internal.compiler.parser.Scanner;
 import net.sourceforge.phpdt.internal.compiler.parser.SyntaxError;
-import net.sourceforge.phpeclipse.mover.obfuscator.PHPIdentifier;
+import net.sourceforge.phpdt.internal.compiler.util.Util;
+import net.sourceforge.phpeclipse.PHPeclipsePlugin;
+import net.sourceforge.phpeclipse.obfuscator.PHPIdentifier;
 
 import org.eclipse.core.resources.IFile;
 import org.eclipse.core.runtime.CoreException;
+import org.eclipse.core.runtime.IStatus;
 
 /**
  * Manages the identifer index information for a specific project
- *
+ *  
  */
 public class IdentifierIndexManager {
-
   public class LineCreator implements ITerminalSymbols {
-
     private Scanner fScanner;
+
     private int fToken;
 
     public LineCreator() {
-      fScanner = new Scanner(false, false);
+      fScanner = new Scanner(true, false, false, false, true, null, null, true /* taskCaseSensitive */);
     }
+
     /**
-     * gets the next token from input
+     * Add the information of the current identifier to the line
+     * 
+     * @param typeOfIdentifier
+     *          the type of the identifier ('c'lass, 'd'efine, 'f'unction, 'm'ethod(class), 'v'ariable(class) 'g'lobal variable)
+     * @param identifier
+     *          current identifier
+     * @param line
+     *          Buffer for the current index line
      */
-    private void getNextToken() {
+    private void addIdentifierInformation(char typeOfIdentifier, char[] identifier, StringBuffer line) {
+      line.append('\t');
+      line.append(typeOfIdentifier);
+      line.append(identifier);
+      //      line.append("\to"); // Offset
+      //      line.append(fScanner.getCurrentTokenStartPosition());
+    }
+
+    /**
+     * Add the information of the current identifier to the line
+     * 
+     * @param typeOfIdentifier
+     *          the type of the identifier ('c'lass, 'd'efine, 'f'unction, 'm'ethod(class), 'v'ariable(class) 'g'lobal variable)
+     * @param identifier
+     *          current identifier
+     * @param line
+     *          Buffer for the current index line
+     * @param phpdocOffset
+     *          the offset of the PHPdoc comment if available
+     * @param phpdocLength
+     *          the length of the PHPdoc comment if available
+     */
+    private void addIdentifierInformation(char typeOfIdentifier, char[] identifier, StringBuffer line, int phpdocOffset,
+        int phpdocLength) {
+      line.append('\t');
+      line.append(typeOfIdentifier);
+      line.append(identifier);
+      line.append("\to"); // Offset
+      line.append(fScanner.getCurrentTokenStartPosition());
+      if (phpdocOffset >= 0) {
+        line.append("\tp"); // phpdoc offset
+        line.append(phpdocOffset);
+        line.append("\tl"); // phpdoc length
+        line.append(phpdocLength);
+      }
+    }
+
+    private void addClassVariableInformation(char typeOfIdentifier, char[] identifier, StringBuffer line, int phpdocOffset,
+        int phpdocLength) {
+      line.append('\t');
+      line.append(typeOfIdentifier);
+      line.append(identifier);
+      line.append("\to"); // Offset
+      // we don't store the '$' in the index for class variables:
+      line.append(fScanner.getCurrentTokenStartPosition() + 1);
+      if (phpdocOffset >= 0) {
+        line.append("\tp"); // phpdoc offset
+        line.append(phpdocOffset);
+        line.append("\tl"); // phpdoc length
+        line.append(phpdocLength);
+      }
+    }
 
+    /**
+     * Get the next token from input
+     */
+    private void getNextToken() {
       try {
         fToken = fScanner.getNextToken();
         if (Scanner.DEBUG) {
           int currentEndPosition = fScanner.getCurrentTokenEndPosition();
           int currentStartPosition = fScanner.getCurrentTokenStartPosition();
-
           System.out.print(currentStartPosition + "," + currentEndPosition + ": ");
           System.out.println(fScanner.toStringAction(fToken));
         }
         return;
       } catch (InvalidInputException e) {
         // ignore errors
+        //        e.printStackTrace();
       }
       fToken = TokenNameERROR;
     }
 
-    private void parseDeclarations(StringBuffer buf, boolean goBack) {
+    private void parseDeclarations(char[] parent, StringBuffer buf, boolean goBack) {
       char[] ident;
+      char[] classVariable;
       int counter = 0;
-
+      boolean hasModifiers = false;
+      int phpdocOffset = -1;
+      int phpdocLength = -1;
       try {
         while (fToken != TokenNameEOF && fToken != TokenNameERROR) {
-          if (fToken == TokenNamevar) {
+          phpdocOffset = -1;
+          hasModifiers = false;
+          if (fToken == TokenNameCOMMENT_PHPDOC) {
+            phpdocOffset = fScanner.getCurrentTokenStartPosition();
+            phpdocLength = fScanner.getCurrentTokenEndPosition() - fScanner.getCurrentTokenStartPosition() + 1;
             getNextToken();
-            if (fToken == TokenNameVariable) {
-              ident = fScanner.getCurrentIdentifierSource();
-              buf.append("\tv");
-              buf.append(ident);
-
+            while (fToken == TokenNamestatic || fToken == TokenNamefinal || fToken == TokenNamepublic
+                || fToken == TokenNameprotected || fToken == TokenNameprivate || fToken == TokenNameabstract) {
+              hasModifiers = true;
               getNextToken();
             }
-          } else if (fToken == TokenNamefunction) {
+            if (fToken == TokenNameEOF || fToken == TokenNameERROR) {
+              break;
+            }
+          }
+          if (fToken == TokenNamefunction) {
             getNextToken();
             if (fToken == TokenNameAND) {
               getNextToken();
             }
             if (fToken == TokenNameIdentifier) {
               ident = fScanner.getCurrentIdentifierSource();
-              buf.append("\tm");
-              buf.append(ident);
+              if (parent != null && equalCharArrays(parent, ident)) {
+                // constructor function
+                addIdentifierInformation('k', ident, buf, phpdocOffset, phpdocLength);
+              } else {
+                if (parent != null) {
+                  // class method function
+                  addIdentifierInformation('m', ident, buf, phpdocOffset, phpdocLength);
+                } else {
+                  // nested function ?!
+                  addIdentifierInformation('f', ident, buf, phpdocOffset, phpdocLength);
+                }
+              }
               getNextToken();
-              parseDeclarations(buf, true);
+              parseDeclarations(null, buf, true);
             }
-          } else if (fToken == TokenNameclass) {
+          } else if (fToken == TokenNameclass || fToken == TokenNameinterface) {
             getNextToken();
             if (fToken == TokenNameIdentifier) {
               ident = fScanner.getCurrentIdentifierSource();
-              buf.append("\tc");
-              buf.append(ident);
+              addIdentifierInformation('c', ident, buf, phpdocOffset, phpdocLength);
               getNextToken();
-
-              //skip tokens for classname, extends and others until we have the opening '{'
+              if (fToken == TokenNameextends) {
+                getNextToken();
+                while (fToken == TokenNameIdentifier) {
+                  ident = fScanner.getCurrentIdentifierSource();
+                  // extends ident
+                  addIdentifierInformation('e', ident, buf);
+                  getNextToken();
+                  if (fToken == TokenNameCOMMA) {
+                    getNextToken();
+                  }
+                }
+              }
+              if (fToken == TokenNameimplements) {
+                getNextToken();
+                while (fToken == TokenNameIdentifier) {
+                  ident = fScanner.getCurrentIdentifierSource();
+                  // implements ident
+                  addIdentifierInformation('e', ident, buf);
+                  getNextToken();
+                  if (fToken == TokenNameCOMMA) {
+                    getNextToken();
+                  }
+                }
+              }
+              //skip tokens for classname, extends and others until we have
+              // the opening '{'
               while (fToken != TokenNameLBRACE && fToken != TokenNameEOF && fToken != TokenNameERROR) {
                 getNextToken();
               }
-              parseDeclarations(buf, true);
+              parseDeclarations(ident, buf, true);
+            }
+          } else if (fToken == TokenNamevar || hasModifiers || fToken == TokenNamestatic || fToken == TokenNamefinal
+              || fToken == TokenNamepublic || fToken == TokenNameprotected || fToken == TokenNameprivate) {
+            while (fToken == TokenNamevar || fToken == TokenNamestatic || fToken == TokenNamefinal || fToken == TokenNamepublic
+                || fToken == TokenNameprotected || fToken == TokenNameprivate) {
+              getNextToken();
+            }
+            while (fToken == TokenNameVariable) {
+              ident = fScanner.getCurrentIdentifierSource();
+              classVariable = new char[ident.length - 1];
+              System.arraycopy(ident, 1, classVariable, 0, ident.length - 1);
+              addClassVariableInformation('v', classVariable, buf, phpdocOffset, phpdocLength);
+              getNextToken();
+              if (fToken == TokenNameCOMMA) {
+                getNextToken();
+              }
             }
-          } else if ((fToken == TokenNameLBRACE) || (fToken == TokenNameDOLLAR_LBRACE)) {
+          } else if (!hasModifiers && fToken == TokenNameIdentifier) {
+            ident = fScanner.getCurrentIdentifierSource();
+            getNextToken();
+            if (ident.length == 6 && ident[0] == 'd' && ident[1] == 'e' && ident[2] == 'f' && ident[3] == 'i' && ident[4] == 'n'
+                && ident[5] == 'e') {
+              if (fToken == TokenNameLPAREN) {
+                getNextToken();
+                if (fToken == TokenNameStringDoubleQuote) {
+                  ident = fScanner.getCurrentStringLiteralSource();
+                  addIdentifierInformation('d', ident, buf, phpdocOffset, phpdocLength);
+                  getNextToken();
+                } else if (fToken == TokenNameStringSingleQuote) {
+                  ident = fScanner.getCurrentStringLiteralSource();
+                  addIdentifierInformation('d', ident, buf, phpdocOffset, phpdocLength);
+                  getNextToken();
+                }
+              }
+            }
+          } else if (fToken == TokenNameglobal) {
+            // global variable
+            while (fToken != TokenNameEOF && fToken != TokenNameERROR && fToken != TokenNameSEMICOLON && fToken != TokenNameLBRACE
+                && fToken != TokenNameRBRACE) {
+              getNextToken();
+              if (fToken == TokenNameVariable) {
+                ident = fScanner.getCurrentIdentifierSource();
+                addIdentifierInformation('g', ident, buf, phpdocOffset, phpdocLength);
+              }
+            }
+          } else if (fToken == TokenNameLBRACE) {
             getNextToken();
             counter++;
           } else if (fToken == TokenNameRBRACE) {
@@ -117,18 +274,34 @@ public class IdentifierIndexManager {
       }
     }
 
-    public void parseIdentifiers(char[] charArray, StringBuffer buf) {
+    synchronized public void parseIdentifiers(char[] charArray, StringBuffer buf) {
       char[] ident;
       String identifier;
       int counter = 0;
-
+      boolean hasModifiers = false;
+      int phpdocOffset = -1;
+      int phpdocLength = -1;
       fScanner.setSource(charArray);
       fScanner.setPHPMode(false);
       fToken = TokenNameEOF;
       getNextToken();
-
       try {
-        while (fToken != TokenNameEOF && fToken != TokenNameERROR) {
+        while (fToken != TokenNameEOF) { // && fToken != TokenNameERROR) {
+          phpdocOffset = -1;
+          hasModifiers = false;
+          if (fToken == TokenNameCOMMENT_PHPDOC) {
+            phpdocOffset = fScanner.getCurrentTokenStartPosition();
+            phpdocLength = fScanner.getCurrentTokenEndPosition() - fScanner.getCurrentTokenStartPosition() + 1;
+            getNextToken();
+            while (fToken == TokenNamestatic || fToken == TokenNamefinal || fToken == TokenNamepublic
+                || fToken == TokenNameprotected || fToken == TokenNameprivate || fToken == TokenNameabstract) {
+              hasModifiers = true;
+              getNextToken();
+            }
+            if (fToken == TokenNameEOF || fToken == TokenNameERROR) {
+              break;
+            }
+          }
           if (fToken == TokenNamefunction) {
             getNextToken();
             if (fToken == TokenNameAND) {
@@ -136,26 +309,69 @@ public class IdentifierIndexManager {
             }
             if (fToken == TokenNameIdentifier) {
               ident = fScanner.getCurrentIdentifierSource();
-              buf.append("\tf");
-              buf.append(ident);
+              addIdentifierInformation('f', ident, buf, phpdocOffset, phpdocLength);
               getNextToken();
-              parseDeclarations(buf, true);
+              parseDeclarations(null, buf, true);
             }
-          } else if (fToken == TokenNameclass) {
+          } else if (fToken == TokenNameclass || fToken == TokenNameinterface) {
             getNextToken();
             if (fToken == TokenNameIdentifier) {
               ident = fScanner.getCurrentIdentifierSource();
-              buf.append("\tc");
-              buf.append(ident);
+              addIdentifierInformation('c', ident, buf, phpdocOffset, phpdocLength);
               getNextToken();
-
-              //skip fTokens for classname, extends and others until we have the opening '{'
+              if (fToken == TokenNameextends) {
+                getNextToken();
+                while (fToken == TokenNameIdentifier) {
+                  ident = fScanner.getCurrentIdentifierSource();
+                  // extends ident
+                  addIdentifierInformation('e', ident, buf);
+                  getNextToken();
+                  if (fToken == TokenNameCOMMA) {
+                    getNextToken();
+                  }
+                }
+              }
+              if (fToken == TokenNameimplements) {
+                getNextToken();
+                while (fToken == TokenNameIdentifier) {
+                  ident = fScanner.getCurrentIdentifierSource();
+                  // implements ident
+                  addIdentifierInformation('e', ident, buf);
+                  getNextToken();
+                  if (fToken == TokenNameCOMMA) {
+                    getNextToken();
+                  }
+                }
+              }
+              //skip fTokens for classname, extends and others until we have
+              // the opening '{'
               while (fToken != TokenNameLBRACE && fToken != TokenNameEOF && fToken != TokenNameERROR) {
                 getNextToken();
               }
-
-              parseDeclarations(buf, true);
-
+              parseDeclarations(ident, buf, true);
+            }
+          } else if (fToken == TokenNameVariable) {
+            // global variable
+            ident = fScanner.getCurrentIdentifierSource();
+            addIdentifierInformation('g', ident, buf, phpdocOffset, phpdocLength);
+            getNextToken();
+          } else if (!hasModifiers && fToken == TokenNameIdentifier) {
+            ident = fScanner.getCurrentIdentifierSource();
+            getNextToken();
+            if (ident.length == 6 && ident[0] == 'd' && ident[1] == 'e' && ident[2] == 'f' && ident[3] == 'i' && ident[4] == 'n'
+                && ident[5] == 'e') {
+              if (fToken == TokenNameLPAREN) {
+                getNextToken();
+                if (fToken == TokenNameStringDoubleQuote) {
+                  ident = fScanner.getCurrentStringLiteralSource();
+                  addIdentifierInformation('d', ident, buf, phpdocOffset, phpdocLength);
+                  getNextToken();
+                } else if (fToken == TokenNameStringSingleQuote) {
+                  ident = fScanner.getCurrentStringLiteralSource();
+                  addIdentifierInformation('d', ident, buf, phpdocOffset, phpdocLength);
+                  getNextToken();
+                }
+              }
             }
           } else {
             getNextToken();
@@ -168,9 +384,25 @@ public class IdentifierIndexManager {
     }
   }
 
+  class StringComparator implements Comparator {
+    public int compare(Object o1, Object o2) {
+      String s1 = (String) o1;
+      String s2 = (String) o2;
+      return s1.compareTo(s2);
+      //       return s1.toUpperCase().compareTo(s2.toUpperCase());
+    }
+
+    public boolean equals(Object o) {
+      String s = (String) o;
+      return compare(this, o) == 0;
+    }
+  }
+
   private HashMap fFileMap;
+
   private String fFilename;
-  private HashMap fIndentifierMap;
+
+  private TreeMap fIndentifierMap;
 
   public IdentifierIndexManager(String filename) {
     fFilename = filename;
@@ -179,117 +411,294 @@ public class IdentifierIndexManager {
   }
 
   /**
+   * Check if 2 char arrays are equal
+   * 
+   * @param a
+   * @param b
+   * @return
+   */
+  private static boolean equalCharArrays(char[] a, char[] b) {
+    if (a.length != b.length) {
+      return false;
+    }
+    for (int i = 0; i < b.length; i++) {
+      if (a[i] != b[i]) {
+        return false;
+      }
+    }
+    return true;
+  }
+
+  public LineCreator createLineCreator() {
+    return new LineCreator();
+  }
+
+  /**
    * Add the information for a given IFile resource
-   *
+   *  
    */
   public void addFile(IFile fileToParse) {
-    InputStream iStream;
-    LineCreator lineCreator = new LineCreator();
+    //    InputStream iStream;
+    LineCreator lineCreator = createLineCreator();
     try {
-      iStream = fileToParse.getContents();
+      addInputStream(new BufferedInputStream(fileToParse.getContents()), fileToParse.getProjectRelativePath().toString(),
+          lineCreator);
+    } catch (CoreException e1) {
+      // TODO Auto-generated catch block
+      e1.printStackTrace();
+    }
+  }
 
-      StringBuffer buf = new StringBuffer();
-      int c0;
+  /**
+   * @param fileToParse
+   * @param lineCreator
+   * @throws CoreException
+   */
+  public void addInputStream(InputStream stream, String filePath, LineCreator lineCreator) throws CoreException {
+    try {
+      StringBuffer lineBuffer = new StringBuffer();
+      lineBuffer.append(filePath);
+      int lineLength = lineBuffer.length();
+      lineCreator.parseIdentifiers(Util.getInputStreamAsCharArray(stream, -1, null), lineBuffer);
+      //      if (lineLength != lineBuffer.length()) {
+      // always add the file for Open Include Action
+      addLine(lineBuffer.toString());
+      //      }
+    } catch (IOException e) {
+      e.printStackTrace();
+    } finally {
       try {
-        while ((c0 = iStream.read()) != (-1)) {
-          buf.append((char) c0);
+        if (stream != null) {
+          stream.close();
         }
       } catch (IOException e) {
-        return;
       }
+    }
+  }
 
-      StringBuffer lineBuffer = new StringBuffer();
-      //      lineBuffer.append(fileToParse.getLocation().toString());
-      lineBuffer.append(fileToParse.getFullPath().toString());
-      int lineLength = lineBuffer.length();
-      lineCreator.parseIdentifiers(buf.toString().toCharArray(), lineBuffer);
-      if (lineLength != lineBuffer.length()) {
-        addLine(lineBuffer.toString());
+  /**
+   * Adds a line of the index file for function, class, class-method and class-variable names
+   * 
+   * @param line
+   */
+  private void addLine(String line) {
+    addLine(fIndentifierMap, fFileMap, line, null);
+  }
+
+  public TreeMap getIdentifiers(IFile file) {
+    TreeMap treeMap = new TreeMap(new StringComparator());
+    addIdentifiers(treeMap, file);
+    return treeMap;
+  }
+  public TreeMap getIdentifiers(String startClazz) {
+    TreeMap treeMap = new TreeMap(new StringComparator());
+    addIdentifiers(treeMap, startClazz);
+    return treeMap;
+  }
+  
+  public void addIdentifiers(TreeMap treeMap, IFile file) {
+    String line = (String) fFileMap.get(file.getProjectRelativePath().toString());
+    if (line != null) {
+      PHPIdentifierLocation ident;
+      ArrayList allClassNames = new ArrayList();
+      addLine(treeMap, null, line, allClassNames);
+      int i=0;
+      while (i<allClassNames.size()) {
+        String clazz = (String) allClassNames.get(i++);
+        addClassName(treeMap, clazz, allClassNames);
       }
-    } catch (CoreException e1) {
-      // TODO Auto-generated catch block
-      e1.printStackTrace();
     }
   }
 
+  public void addIdentifiers(TreeMap treeMap, String startClazz) {
+    PHPIdentifierLocation ident;
+    ArrayList allClassNames = new ArrayList();
+    addClassName(treeMap, startClazz, allClassNames);
+    int i=0;
+    while (i<allClassNames.size()) {
+      String clazz = (String) allClassNames.get(i++);
+      addClassName(treeMap, clazz, allClassNames);
+    }
+  }
+
+  /**
+   * @param treeMap
+   * @param clazz
+   * @param allClassNames
+   */
+  private boolean addClassName(TreeMap treeMap, String clazz, List allClassNames) {
+    String line;
+    PHPIdentifierLocation ident;
+    List list = getLocations(clazz);
+    if (list==null) {
+      return false;
+    }
+    boolean result = false;
+    for (int i = 0; i < list.size(); i++) {
+      ident = (PHPIdentifierLocation) list.get(i);
+      if (ident.isClass()) {
+        line = (String) fFileMap.get(ident.getFilename());
+        addLine(treeMap, null, line, allClassNames);
+        result = true;
+      }
+    }
+    return result;
+  }
+
   /**
    * Adds a line of the index file for function, class, class-method and class-variable names
    * 
    * @param line
    */
-  private void addLine(String line) {
+  public void addLine(TreeMap treeMap, HashMap fileMap, String line, List allClassNames) {
     StringTokenizer tokenizer;
     String phpFileName = null;
     String token;
     String identifier = null;
     String classname = null;
-    PHPIdentifier phpIdentifier = null;
+    String offset = null;
+    PHPIdentifierLocation phpIdentifier = null;
     boolean tokenExists = false;
-
     tokenizer = new StringTokenizer(line, "\t");
     // first token contains the filename:
-    if (tokenizer.hasMoreTokens()) {
-      phpFileName = tokenizer.nextToken();
-      //System.out.println(token);
-    } else {
-      return;
-    }
-    // all the other tokens are identifiers:
-    while (tokenizer.hasMoreTokens()) {
-      token = tokenizer.nextToken();
-      //System.out.println(token);
-      switch (token.charAt(0)) {
-        case 'c' : // class name
+    try {
+      if (tokenizer.hasMoreTokens()) {
+        phpFileName = tokenizer.nextToken();
+        //System.out.println(token);
+      } else {
+        return;
+      }
+      // all the other tokens are identifiers:
+      while (tokenizer.hasMoreTokens()) {
+        token = tokenizer.nextToken();
+        //System.out.println(token);
+        switch (token.charAt(0)) {
+        case 'c':
+          // class name
           identifier = token.substring(1);
           classname = identifier;
           phpIdentifier = new PHPIdentifierLocation(identifier, PHPIdentifier.CLASS, phpFileName);
           break;
-        case 'f' : // function name
+        case 'd':
+          // define
+          identifier = token.substring(1);
+          phpIdentifier = new PHPIdentifierLocation(identifier, PHPIdentifier.DEFINE, phpFileName);
+          break;
+        case 'e':
+          // extends <class name>
+          // not in map
+          identifier = null;
+          phpIdentifier = null;
+          if (allClassNames != null) {
+            String extName = token.substring(1);
+            if (!allClassNames.contains(extName)) {
+              allClassNames.add(extName);
+            }
+          }
+          break;
+        case 'f':
+          // function name
           identifier = token.substring(1);
           phpIdentifier = new PHPIdentifierLocation(identifier, PHPIdentifier.FUNCTION, phpFileName);
           break;
-        case 'm' : //method inside a class
+        case 'g':
+          // global variable
+          identifier = token.substring(1);
+          phpIdentifier = new PHPIdentifierLocation(identifier, PHPIdentifier.GLOBAL_VARIABLE, phpFileName);
+          break;
+        case 'i':
+          // implements <class name>
+          // not in map
+          identifier = null;
+          phpIdentifier = null;
+          if (allClassNames != null) {
+            String implName = token.substring(1);
+            if (!allClassNames.contains(implName)) {
+              allClassNames.add(implName);
+            }
+          }
+          break;
+        case 'k':
+          // constructor function name
+          identifier = token.substring(1);
+          phpIdentifier = new PHPIdentifierLocation(identifier, PHPIdentifier.CONSTRUCTOR, phpFileName);
+          break;
+        case 'm':
+          //method inside a class
           identifier = token.substring(1);
           phpIdentifier = new PHPIdentifierLocation(identifier, PHPIdentifier.METHOD, phpFileName, classname);
           break;
-        case 'v' : // variable inside a class
+        case 'v':
+          // variable inside a class
           identifier = token.substring(1);
           phpIdentifier = new PHPIdentifierLocation(identifier, PHPIdentifier.VARIABLE, phpFileName, classname);
           break;
-        default :
+        case 'o':
+          // offset information
+          identifier = null;
+          if (phpIdentifier != null) {
+            offset = token.substring(1);
+            phpIdentifier.setOffset(Integer.parseInt(offset));
+          }
+          break;
+        case 'p':
+          // PHPdoc offset information
+          identifier = null;
+          if (phpIdentifier != null) {
+            offset = token.substring(1);
+            phpIdentifier.setPHPDocOffset(Integer.parseInt(offset));
+          }
+          break;
+        case 'l':
+          // PHPdoc length information
+          identifier = null;
+          if (phpIdentifier != null) {
+            offset = token.substring(1);
+            phpIdentifier.setPHPDocLength(Integer.parseInt(offset));
+          }
+          break;
+        default:
+          PHPeclipsePlugin.log(IStatus.ERROR, "Unknown token character in IdentifierIndexManager: " + token.charAt(0));
           identifier = null;
           phpIdentifier = null;
           classname = null;
-      }
-      if (identifier != null && phpIdentifier != null) {
-        tokenExists = true;
-        ArrayList list = (ArrayList) fIndentifierMap.get(identifier);
-        if (list == null) {
-          list = new ArrayList();
-          list.add(phpIdentifier);
-          fIndentifierMap.put(identifier, list);
-        } else {
-          boolean flag = false;
-          for (int i = 0; i < list.size(); i++) {
-            if (list.get(i).equals(phpIdentifier)) {
-              flag = true;
-              break;
-            }
-          }
-          if (flag == false) {
+        }
+        if (identifier != null && phpIdentifier != null) {
+          tokenExists = true;
+          ArrayList list = (ArrayList) treeMap.get(identifier);
+          if (list == null) {
+            list = new ArrayList();
             list.add(phpIdentifier);
+            treeMap.put(identifier, list);
+          } else {
+            boolean flag = false;
+            for (int i = 0; i < list.size(); i++) {
+              if (list.get(i).equals(phpIdentifier)) {
+                flag = true;
+                break;
+              }
+            }
+            if (flag == false) {
+              list.add(phpIdentifier);
+            }
           }
         }
       }
+      if (fileMap != null) {
+        fileMap.put(phpFileName, line);
+      }
+    } catch (Throwable e) {
+      // write to workspace/.metadata/.log file
+      PHPeclipsePlugin.log(e);
     }
-    if (tokenExists) {
-      fFileMap.put(phpFileName, line);
-    }
+    //    if (tokenExists) {
+
+    //    }
   }
 
   /**
    * Change the information for a given IFile resource
-   *
+   *  
    */
   public void changeFile(IFile fileToParse) {
     removeFile(fileToParse);
@@ -308,21 +717,18 @@ public class IdentifierIndexManager {
 
   /**
    * Initialize (i.e. clear) the current index information
-   *
+   *  
    */
   public void initialize() {
-    fIndentifierMap = new HashMap();
+    fIndentifierMap = new TreeMap(new StringComparator());
     fFileMap = new HashMap();
   }
 
   private void readFile() {
-
     FileReader fileReader;
     try {
       fileReader = new FileReader(fFilename);
-
       BufferedReader bufferedReader = new BufferedReader(fileReader);
-
       String line;
       while (bufferedReader.ready()) {
         // all entries for one file are in a line
@@ -330,7 +736,6 @@ public class IdentifierIndexManager {
         line = bufferedReader.readLine();
         addLine(line);
       }
-
       fileReader.close();
     } catch (FileNotFoundException e) {
       // ignore this
@@ -339,16 +744,16 @@ public class IdentifierIndexManager {
       // TODO Auto-generated catch block
       e.printStackTrace();
     }
-
   }
 
   /**
    * Remove the information for a given IFile resource
-   *
+   *  
    */
   public void removeFile(IFile fileToParse) {
-    //    String line = (String) fFileMap.get(fileToParse.getLocation().toString());
-    String line = (String) fFileMap.get(fileToParse.getFullPath().toString());
+    //    String line = (String)
+    // fFileMap.get(fileToParse.getLocation().toString());
+    String line = (String) fFileMap.get(fileToParse.getProjectRelativePath().toString());
     if (line != null) {
       removeLine(line);
     }
@@ -367,7 +772,6 @@ public class IdentifierIndexManager {
     String classname = null;
     PHPIdentifier phpIdentifier = null;
     boolean tokenExists = false;
-
     tokenizer = new StringTokenizer(line, "\t");
     // first token contains the filename:
     if (tokenizer.hasMoreTokens()) {
@@ -376,32 +780,75 @@ public class IdentifierIndexManager {
     } else {
       return;
     }
+    int offset = -1;
     // all the other tokens are identifiers:
     while (tokenizer.hasMoreTokens()) {
       token = tokenizer.nextToken();
       //System.out.println(token);
       switch (token.charAt(0)) {
-        case 'c' : // class name
-          identifier = token.substring(1);
-          classname = identifier;
-          phpIdentifier = new PHPIdentifierLocation(identifier, PHPIdentifier.CLASS, phpFileName);
-          break;
-        case 'f' : // function name
-          identifier = token.substring(1);
-          phpIdentifier = new PHPIdentifierLocation(identifier, PHPIdentifier.FUNCTION, phpFileName);
-          break;
-        case 'm' : //method inside a class
-          identifier = token.substring(1);
-          phpIdentifier = new PHPIdentifierLocation(identifier, PHPIdentifier.METHOD, phpFileName, classname);
-          break;
-        case 'v' : // variable inside a class
-          identifier = token.substring(1);
-          phpIdentifier = new PHPIdentifierLocation(identifier, PHPIdentifier.VARIABLE, phpFileName, classname);
-          break;
-        default :
-          identifier = null;
-          phpIdentifier = null;
-          classname = null;
+      case 'c':
+        // class name
+        identifier = token.substring(1);
+        classname = identifier;
+        phpIdentifier = new PHPIdentifierLocation(identifier, PHPIdentifier.CLASS, phpFileName);
+        break;
+      case 'd':
+        // define
+        identifier = token.substring(1);
+        phpIdentifier = new PHPIdentifierLocation(identifier, PHPIdentifier.DEFINE, phpFileName);
+        break;
+      case 'e':
+        // extends <class name>
+        identifier = null;
+        phpIdentifier = null;
+        break;
+      case 'f':
+        // function name
+        identifier = token.substring(1);
+        phpIdentifier = new PHPIdentifierLocation(identifier, PHPIdentifier.FUNCTION, phpFileName);
+        break;
+      case 'g':
+        // global variable
+        identifier = token.substring(1);
+        phpIdentifier = new PHPIdentifierLocation(identifier, PHPIdentifier.GLOBAL_VARIABLE, phpFileName);
+        break;
+      case 'i':
+        // implements <class name>
+        identifier = null;
+        phpIdentifier = null;
+        break;
+      case 'k':
+        // constructor function name
+        identifier = token.substring(1);
+        phpIdentifier = new PHPIdentifierLocation(identifier, PHPIdentifier.CONSTRUCTOR, phpFileName);
+        break;
+      case 'm':
+        //method inside a class
+        identifier = token.substring(1);
+        phpIdentifier = new PHPIdentifierLocation(identifier, PHPIdentifier.METHOD, phpFileName, classname);
+        break;
+      case 'o':
+        // offset information
+        identifier = null;
+        break;
+      case 'p':
+        // PHPdoc offset information
+        identifier = null;
+        break;
+      case 'l':
+        // PHPdoc length information
+        identifier = null;
+        break;
+      case 'v':
+        // variable inside a class
+        identifier = token.substring(1);
+        phpIdentifier = new PHPIdentifierLocation(identifier, PHPIdentifier.VARIABLE, phpFileName, classname);
+        break;
+      default:
+        PHPeclipsePlugin.log(IStatus.ERROR, "Unknown token character in IdentifierIndexManager: " + token.charAt(0));
+        identifier = null;
+        phpIdentifier = null;
+        classname = null;
       }
       if (identifier != null && phpIdentifier != null) {
         ArrayList list = (ArrayList) fIndentifierMap.get(identifier);
@@ -424,7 +871,7 @@ public class IdentifierIndexManager {
 
   /**
    * Save the current index information in the projects index file
-   *
+   *  
    */
   public void writeFile() {
     FileWriter fileWriter;
@@ -438,9 +885,38 @@ public class IdentifierIndexManager {
         fileWriter.write(line + '\n');
       }
       fileWriter.close();
+    } catch (FileNotFoundException e) {
+      // ignore exception; project is deleted by user
     } catch (IOException e) {
       // TODO Auto-generated catch block
       e.printStackTrace();
     }
   }
+
+  /**
+   * @param fromKey
+   * @param toKey
+   * @return
+   */
+  public SortedMap getIdentifierMap() {
+    return fIndentifierMap;
+  }
+
+  synchronized public List getFileList(String filePattern) {
+    Set set = fFileMap.keySet();
+    if (set.isEmpty()) {
+      return null;
+    }
+    Iterator iter = set.iterator();
+    ArrayList list = new ArrayList();
+    String fileName;
+    int index;
+    while (iter.hasNext()) {
+      fileName = (String) iter.next();
+      if ((index = fileName.indexOf(filePattern)) != -1 && fileName.length() == (index + filePattern.length())) {
+        list.add(fileName);
+      }
+    }
+    return list;
+  }
 }
\ No newline at end of file